1、申请日本研究生渠道一：自己申请研究生，读一段研究生课程，再去参加大学院修士入学考试。
这种难度相对来说比较大，一般要求学生自身的语言能力高，也就是学生们中称的：DIY 申请方式。
2、申请日本研究生渠道二：直接参加申请学校的大学院修士入学考试。
除了要求学生有较高的语言写作会话的能力以外，还需要有较高的专业方面的成绩做基础。学生成功的比率也较少。另外，国立大学要求学生有长期签证在日本直接参加大学院修士入学考试;部分私立大学同意学生可以在中国本土提交申请表，以材料审查的形式直接申请大学院修士入学。
3、申请日本研究生渠道三：申请语言学校作为过渡，学习日语，然后再挑选方式1或方式2攻读修士学位。
目前绝大部分同学采取的，也是比较传统的解决方法，先选择一所教学质量好，在指导留学生申请研究生方面有丰富经验的优秀语言学校过渡，一方面可以做最后的日语强化，特别是提高口语和听力水平。另一方面可以借助语言学校升学指导老师的帮助，来进行申请文件、面试等相关事宜。这种作法因为能让学生打下坚实的日语基础、对希望申请的教授事先有较充分的了解和选择，同时又可以按日本教授习惯的录取模式与导师接触，在实际申请中的益处是很明显的。
4.申请日本研究生渠道四：部分私立大学设立了别科。
学生对日本私立大学专业感兴趣的话，可以从国内直接申请该大学的预科，然后通过日语学习后，申请该校的修士入学考试。
申请日本的研究生，就多年经验来看，只要毕业有学位证，有半年以上的全日制日语基础(500-600以上的日语学时证明)，有英文成绩(四、六级亦可)就可以申请到国公立大学的研究生课程，如果有学生有日语一级证书，又学得是理工科，甚至可以申请东京工业大学、大阪大学、京都大学等世界前百名的著名国立大学。